เป็นการผ่าตัดที่มีความเสี่ยงต่ำมาก ความเสี่ยงทั่วไปคืออาการปวด บวม หรือเลือดออกหลังการผ่าตัด สำหรับปุ่มกระดูกที่เพดานปาก มีความเสี่ยงน้อยมากในการเกิดรูทะลุโพรงจมูกหากทำโดยผู้เชี่ยวชาญ หรือปุ่มกระดูกขากรรไกรล่างอาจมีความเสี่ยงต่อเส้นประสาทที่ลิ้น ซึ่งการผ่าตัดโดยทันตแพทย์เฉพาะทางศัลยกรรมในช่องปากที่มีความเชี่ยวชาญ (Oral Surgeon or Maxillofacial surgeon) จะช่วยลดความเสี่ยงเหล่านี้ให้เหลือน้อยที่สุด