โดยทั่วไปแล้ว การจัดฟันใส Invisalign มีอาการเจ็บปวดน้อยกว่าการจัดฟันโลหะมาก ผู้ป่วยอาจรู้สึกตึงหรือแน่นเล็กน้อยในช่วง 2-3 วันแรกหลังจากเปลี่ยนชุดอุปกรณ์ใหม่ ซึ่งเป็นสัญญาณว่าฟันกำลังเคลื่อนที่ และอาการนี้จะค่อยๆ ดีขึ้น เนื่องจากมีการเปลี่ยนเครื่องมือจัดฟันหลายชิ้นต่อเดือน ซึ่งเป็นการค่อยๆเคลื่อนฟันทีละน้อย แต่บ่อยๆ ทำให้ไม่รู้สึกปวดหรือตึงฟันเกินไปในวันที่ปรับลวดเหมือนการจัดฟันโลหะ เพราะการจัดฟันโลหะต้องปรับลวดเดือนละครั้ง (3-4 สัปดาห์ต่อครั้ง) การเคลื่อนฟันด้วยการจัดฟัแบบโลหะ จึงอาจจะรู้สึกตึงฟันมากกว่า